Із 2001 року Марк Айзекс зняв понад 10 творчих документальних фільмів для BBC та Channel 4. Його стрічки здобули призи Ґрірсона, Королівської телевізійної спілки і BAFTA, а також численні нагороди міжнародних фестивалів. У 2006 році відбулась його ретроспектива на фестивалі États généraux du film documentaire у місті Люсса. Його фільми згадувалися у численних книгах і наукових дослідженнях про документальне кіно. У 2008 році Марк Айзекс отримав почесний докторський ступінь Університету Іст-Лондона за свій документальний доробок. Зараз він гостьовий викладач Лондонської кіношколи, Національної школи кіно і телебачення та Королівського університету Голловей.